秸秆收储运营模式一：
农民收集晾晒→收储公司收购、打包→运输公司负责运送→电厂
(1)秸秆由农户分散收集晾晒
作物收获以后，是以现有农户作为秸秆的主要收集者，进行秸秆的收集、晾晒、储存、保管，按照秸秆直燃的质量要求交售秸秆。农作物秸秆都具有泡、松、软的特征，以及易燃、易腐等特点，其收获、集中和作为商品前的储存作业，有千家万户的农民来完成。因经过传统的收割、脱果、翻晒和倒转等流程后便可大大降低其水分含量，然后再堆垛储存，则不会发生霉变和自然现象。
(2)设立专业秸秆收储公司，对秸秆统一收储管理
秸秆发电厂具备规模后，秸秆便会成为一种商品，一些秸秆收储公司会如雨后春笋般相继出现。 经纪人设立专业秸秆收储公司或将现存的粮棉收购机构等社会资源组建专业的秸秆收储公司。按照电厂统一质量标准，对农户交售秸秆的含水、含沙和发霉变质程度进行质量检测、称重、支付货款，然后售出。公司对己收购的秸秆打捆（标准捆）、堆垛、统一防潮、防水和保存。秸秆收储公司，是以乡镇为中心，按照一定储量标准，在一定区域范围内，分散设立一个或若干个秸秆收储点，形成一个收储网络系统，调控秸秆收储量，并按电厂使用计划、及时、保质、保量、运送秸秆到厂，农作秸秆可以经过秸秆颗粒机、秸秆制粒机压制成生物质颗粒燃料，生物质颗粒燃料又成“秸秆煤”，这样不仅做到了农作物秸秆的综合利用，而且还能是老百姓的收入增加。
在市场经济条件下，只要存在稳定的市场需求，秸秆收储站就会存在。只要直燃电厂与企业法人一秸秆收储公司签订供货合同，使秸秆的供应变成企业法人之间的商业活动，从根本上解决传统秸秆供应的随意性和风险。另外秸秆收储站为了保证秸秆的稳定收购，在农闲季节收购站应派出经纪人与千家万户的农户签订秸秆购买合同，合同中应注明交售购买数量，及对秸秆的质量要求与交货时间等。
(3)运输行业统一运送秸秆到厂
中国运输行业基本市场化，秸秆收储公司可以充分利用社会的运输资源，按照与电厂签订的合同要求，由运输商准时、保质保量、经济高效的将秸秆运输到电厂。
秸秆收储运营模式二：
电厂自行收集、晾晒、运输、储存
电厂自行操控秸秆收储运全过程的运营模式。秸秆发电厂自己经营秸秆的收集、运输、储存、管理及各个环节的工作。农户收购粮食后对秸秆收集、晾晒、打包、储存和保管，然后由电厂派出专业收购人员到农户家中收购，再有电厂派出运输车辆到各家各户装卸运输。运往到电厂后存放到电厂仓库中。
秸秆收储运营模式三：
农民收集、晾晒、打捆、运输、交货
农户收购粮食后，秸秆由农户自行收集、晾晒、打包和保管，根据与电厂签订的供货合同，按时保质的交货秸秆，使用农用三轮车送往电厂。
秸秆收储运营模式四：混合模式
此种运营模式包含了模式一、二、三等三种运营模式，每种运营模式各占一定的比例，每种模式的大小不确定，属于随机事件，此种模式是目前情况下的运作模式。
