1、冷冻干燥过程中突然断电
冷冻干燥过程一般时间较长，如果在于燥过程中突然断电，可导致样品活性丧失。因此要及时对样品进行处理。从机器中取出样品（确保操作过程在无菌条件下进行，防止样品污染），放入冰柜中深层冷冻。在重新装样上机前，要把冷仓内的水分排净，并且仓内温度达到- 25℃以下（指示灯亮），才能重新装样。
2、真空效果不好
AIPHA l/6型真空冷冻干燥烘干机的主要部件之一是DU0004型旋转叶片式真空泵是二级泵，最大真空度为1×10-4mbar。抽气量为4m3/h。真空度不好就会影响样品的质量。如：干燥过程中发生样品溶化，而失去活性等。所以维护和使用好真空泵是保障机器正常运转的必要条件。
2.1真空泵不启动
(1)检查泵上的过电保护开关；(2)检查泵的电路部分，看是否有零件损坏，及时更换。
2.2泵启动但又停止
检查发动机保护开关、定子中的电阻器、热敏电阻保护开关、启动控制器等部件是否损坏。
2.3泵启动但不产生真空
(1)高压安全阀由于脏物污染而没被完全打开，需拆下清洗；(2)电磁阀污染，拆下清洗或更换；(3)滑阀弹簧破碎。
2.4泵达不到极限压力
(1)泵油不够或油被污染，换油；(2)真空室或进气管漏气。把泵从主机上拆下，检查能否达到最大压力，如泵没问题，用真空脂密封泄漏处；(3)真空室污染，取下清洗；(4)检查减压阀是否需清洗或换密封垫；(5)真空安全阀被脏物卡住，或簧环故障，使操作活塞松动；(6)滑阀弹簧破碎；(7)滑阀或气缸壁损坏；(8)真空传感器使用寿命较短，检查一下是否需要修理或更换，如有可能，用校正仪校正一下真空度读数。如果指示有偏差，可以通过调节真空传感器的电位器Rl和R2来校正（见图1）。
2.5泵的噪音过大
(1)检查消音器、气镇阀等是否正常；(2)滑阀弹簧破碎，换弹簧，检查阀的磨损程度；(3)泵隙间或发动机与泵间的偶合间隙增大。
3、压缩机不制冷
冷冻干燥烘干机的制冷系统装有一个过压保护装置F1和一个过热超载保护装置F2，在环境温度过高或压缩机超负荷时，这些保护装置就会启动切断电源，一旦达到要求的操作条件，压缩机通过F1和F2会重新自动启动，注意：真空冷冻干燥烘干机最好安装在有空调的室内。
