传统的酵母发酵乙醇技术用于糖或淀粉含量高的生物质已经趋于成熟。并有较大规模应用，而对于含大量纤维素的植物来讲，首先预处理生物质得到纤维素和半纤维素，去除阻碍糖化和发酵的物质，使其更容易被降解和发酵；然后用酸或酶水解聚合物成单糖(包括五碳糖和六碳糖)；用基因工程菌发酵六碳糖和五碳糖生成乙醇，而木质素不能转化为乙醇，它可以和其它不能转化成乙醇的残渣一起作为燃料使用，为生产提供动力。
    纯酒精或汽油和酒精的混合物都可以作为燃料。混有体积分数为20％的酒精的汽油辛烷值高，能清洁燃烧，而且不必对汽车发动机作较大的改造。预计未来非粮生物质水解发酵制燃料乙醇的成本将低于用粮食发酵法生产乙醇的成本，有着其它原料生产燃料乙醇不可比拟的优势，不少国家已在多年以前就开展此项工作。目前还没有实现大规模工业化生产，今后应开发生物质处理新技术，培育价廉高活力的新型纤维素酶及五碳糖六碳糖同步发酵的新菌种，研发出流程短、效率高、能耗低的生物质生产乙醇新工艺，从而降低乙醇生产成本，同时应注重副产物的开发，早日实现生物质生产燃料乙醇的产业化。
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